El 17 de Agosto de 1742 Juan Bautista Arbaiza comienza las obras de las torres y otras zonas de la Iglesia.

En 1748, tras la muerte de Arbaiza, es Martín de Beratua quien se hace cargo de la continuación.

El paro de las obras por falta de dinero, con la fachada ejecutada y la torre su a medio levantar, hace que se resquebraje por la descompensación de pesos (se puede apreciar a simple vista).

En 1754 se termina la torre sur, de 58 metros, y en 1756 la torre norte, de 56 metros. Observando el Retablo Mayor descubriremos por qué se llaman San Pablo y San Pedro respectivamente.